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il nous présentera les travaux réalisés pendant sa thèse dans l'UMR PHIM, CIRAD-ANSES sur :

Une architecture adaptative complexe impliquée dans l'érosion de résistances variétales chez Pseudocercospora fijiensis, agent causal de la maladie des raies noires du bananier

Résumé :

Dans les systèmes de production agricole, l’utilisation de résistances variétales représente une alternative écologique aux produits phytosanitaires pour lutter contre les agents pathogènes de plantes. Cependant, il existe de nombreux exemples de contournement ou d‘érosion de résistances variétales dues à l’adaptation des populations d’agents pathogènes. Un exemple récent est celui de l‘érosion de résistances quantitatives du bananier par le champignon Pseudocercospora fijiensis, agent responsable de la Maladie des Raies Noires (MRN). Des inoculations croisées en conditions contrôlées ont permis de mettre en évidence l’adaptation locale des populations de P. fijiensis à Cuba et en République Dominicaine vis-à-vis de variétés partiellement résistantes. Dans cette étude, des approches de génomique des populations et de génétique quantitative ont été utilisées pour identifier les bases génétiques et l’architecture adaptative chez P. fijiensis, impliquée dans l’adaptation aux résistances quantitatives déployées à Cuba. Ces analyses combinant des données de séquençage en “pool” et des données de génotypage/phénotypage individuel ont permis d’identifier une trentaine de régions génomiques potentiellement impliquées dans l’adaptation à ces résistances. Ces résultats suggèrent une architecture adaptative complexe impliquant une base génétique polygénique, de la redondance fonctionnelle et peu de convergence évolutive entres les populations étudiées. L’annotation des gènes détectés dans les régions génomiques et des données biologiques confortent l’hypothèse que certains d’entre eux puissent jouer un rôle dans la pathogénicité. Cette étude apporte des premiers éléments et une méthodologie pour comprendre l’adaptation des champignons aux résistances quantitatives.

Venez nombreux !