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Dernière mise à jour : Mai 2018

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UMR 1065 Santé et Agroécologie du Vignoble

Frédéric Fabre

Frédéric Fabre
Chargé de recherche, INRAE

Epidemiology /Mathematical modelling / Durable resistance / Pathogen evolution / Decision support system

Tél :(33) 05 57 12 26 42
Mail : frederic.fabre@inrae.fr
ORCID / Research Gate / Google Scholar
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Expérience professionnelle et formation

  • since 2014 : Researcher at INRA in plant pathogens epidemiology and evolution, UMR SAVE, Bordeaux, France.
  • 2005-2013 : Researcher at INRA in plant virus epidemiology and evolution, UR Plant Pathology, Avignon, France.
  • 2001-2004 : PhD Thesis in Applied Ecology and Agronomy at INRA, UMR BiO3P, Rennes, France. Thesis funded by Bayer Crop Science.
  • 1999-2001 : Researcher at CIRAD, UMR PV BMT, Saint Pierre de la Réunion, France.
  • 1996-1999 : Master in Plant Protection at Agro-Campus Ouest, Rennes, France.

Thématiques de recherche et compétences

My scientific interests are related with the epidemiology and evolutionary biology of plant pathogens. My work aim to understand the interplay between the evolutionary and epidemiological processes acting on plant virus and plant fungi population from the host to the landscape scales. To this end, I mainly use mathematical models and statistical inference methods.

An applied perspective is to derive durable management strategies of plant disease resistance in agricultural ecosystems. I am also interest in developing decision support system (DSS) aiming to estimate the need and the timing of one or several protection measures along the cropping season.

Publications significatives

  • Fabre F., Rousseau E., Mailleret L., Moury B. 2015. Epidemiological and evolutionary management of plant resistance: optimizing the deployment of cultivar mixtures in time and space in agricultural landscapes. Evolutionary Applications, 8 (10), 919-932.
  • Fabre F., Moury B. (1), Johansen E.I., Simon V., Jacquemond M. & Senoussi R. 2014. Narrow bottlenecks affect Pea Seedborne Mosaic Virus populations during vertical seed transmission but not during Leaf Colonization. Plos Pathogens, 10 (1) e1003833.
  • Fabre F., Rousseau E., Mailleret L. & Moury B. 2012. Durable strategies to deploy plant resistance in agricultural landscapes. New Phytologist, 193 (4) 1064-1075.
  • Fabre F., Montarry J.(1), Coville J., Senoussi R., Simon V. & Moury B. 2012. Modelling the evolutionary dynamics of viruses within their hosts: a case study using high-throughput sequencing. Plos Pathogens, 8 (4) e1002654.
  • Dedryver C.-A., Le Ralec A. & Fabre F. 2010. The conflicting relationships between aphids and men: A review of aphid damage and control strategies. Comptes Rendus Biologies, 333 (6-7) 539-553.
  • Fabre F., Chadoeuf J., Costa C., Lecoq H. & Desbiez C. 2010. Asymmetrical over-infection as a process of plant virus emergence. Journal of Theoretical Biology, 265 (3) 377-388.
  • Moury B., Fabre F.(1) & Senoussi R. 2007. Estimation of the number of virus particles transmitted by an insect vector. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 104, 17891-17896.
  • Plantegenest M., Le May C. & F. Fabre. 2007. Landscape epidemiology of plant diseases. Journal of the Royal Society Interface, 4, 963-972.

 (1) The 2 first authors contributed equally to the work.