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Dernière mise à jour : Mai 2018

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UMR 1065 Santé et Agroécologie du Vignoble

Shuxian Li

Shuxian Li
Doctorante de octobre 2012 à décembre 2015

Shuxian Li (1988, Chine)
http://lishuxian.github.io/

Sujet de thèse : Détermination des facteurs environnementaux et culturaux liés à l'esca de la vigne par une approche de modélisation spatio-temporelle

  • encadrement : Lucia Guérin
  • collaboration scientifique : Bordeaux Science Agro, INRIA, UFR Sciences et Modélisation (IMB)
  • financement : CASDAR V1303
  • doctorat de l'université de Bordeaux 

Résumé

Esca, a major fungal wood disease of grapevine in France, whose widespread distribution in vineyards leads to vine decline and to reduced productivity,  expresses internal wood necroses and external foliar symptoms.  

It is always assumed that for plants planted in rows, the spatial structures vary between along-row and across-row directions for agricultural reasons such as vine proximity and pruning. In order to better understand the factors driving the spread of this disease, this study was designed to :

  • characterize the spatial structure of manifest esca;
  •  identify and estimate the combined effects of the environmental factors.

Several plots of 2000 contiguous vines planted in rows was monitored visually annually, from 2004 to 2011, for esca symptom foliar expression.  In order to analyse the data, we used logistic hierarchical models with or without regression on covariates, as well as a latent spatio-temporal field specifically adapted to the hidden epidemic of esca.

The models were estimated by R-INLA software within the Bayesian framework using integrated nested Laplace approximation (Cameletti, 2013).

Thèse soutenue le 16 décembre 2015

Voir aussi

Formations

  • 2012 - préparation d'un Phd en statistiques en Biologie, Université de Bordeaux I
  • 2011 - 2012 Master 2 d'ingénierie mathématique spécialité statistiques appliquées, Université Paris II
  • 2010 - 2011 Master 1 de Mathématiques fondamentales et appliquées, Université Paris II
  • 2006 - 2010 Licence de mathématiques appliquées, Université de Wuhan, Chine.

Expériences professionnelles

  • 2012 : Stage à Agro-Paris tech pour l'INRA de Bordeaux, sous la direction de J-J Daudin, intitulé "Modélisation de la dynamique temporelle des infestations de processionnaire du pin"
  • 2008-2010 : Finition d'un projet relatif au coût de la perturbation de la chaîne d'approvisionnement sous la direction de YI Xuming (vice ministre de le faculté de mathématiques)
  • 2006 : Stage à la Banque agricole de Beijing (Branche de Xiantao)

Connaissances

  • Informatique : logiciels Matlab, R, SAS, C++; bonne connaissance de Office (Word, Excel, PowerPoint), LATEX.
  • Statistiques : régression linéaire/non linéaire, modèle linéaire généralisé, séries temporelles (processus ARMA/GARCH/ARIMA/SARIMA/ARFIMA), méthode bayésienne, data mining, statistiques du risque (les valeurs extrêmes, Threshold model, VaR), statistiques financières, methodology
  • Méthodes numériques : techniques de simulation, méthodes de Monte-Carlo par chaîne de Markov.Spécialités : ondelettes, bio statistiques, statistiques spatiales, classification (modèle mélange de gaussienne).

Langues

  • Chinois : langue maternelle
  • Anglais : lu, écrit,et parlé de bon niveau (Gmat 640 4.0)
  • Français : niveau courant.