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Résumé :

Le microbiote associé aux sols et plantes cultivées joue un rôle important dans la santé et la productivité des agro-écosystèmes, et notamment des vignobles. En effet, de très nombreux micro-organismes se développent sur les différentes parties du pied de vigne (baies, feuilles, racines) et vont influencer le développement du raisin. Ces microbiotes sont des compartiments complexes aux équilibres minces : les micro-organismes vont jouer des rôles fonctionnels variés (pathogène ou bénéfique) et ils peuvent aussi évoluer au cours du temps (à l’échelle d’une saison ou dans un contexte d’évolution des conditions au cours des années).
L’objectif du projet est de caractériser le microbiote associé aux écosystèmes viticoles à forte résilience, c’est-à-dire qui produisent une importante quantité de raisins (fort rendement), de bonne qualité et de manière constante au fil des saisons ; et d’identifier des bioindicateurs microbiens de ces vignobles à fort potentiel agronomique. 

Pour y parvenir, des approches complémentaires de métabarcoding sont en cours, et seront suivies d’analyses différentielles d’abondance et de l'utilisation d’algorithmes d’apprentissage supervisé. Les résultats obtenus pourront contribuer aux futurs programmes de biosurveillance et de biocontrôle au vignoble.
Ce projet est étroitement lié au projet ANR VITAE (2020-26) qui a pour but de cultiver la vigne sans pesticides en intégrant de multiples leviers de gestion, y compris le biocontrôle microbien des maladies (WP1).

Venez nombreux !