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Janvier 2015 – Un nouvel article publié dans Current Genetics

19 février 2015

La variabilité intraspecifique des gènes mitochondriaux d’Agaricus bisporus révèle une grande mobilité des Introns de groupe 1accompagnée d’un faible taux de substitutions nucléotidiques

Un travail réalisé dans le cadre de la thèse de Banafsheh Jalalzadeh qui portait sur  l’évolution intraspécifique du génome et modes de reproduction générateurs de diversité génétique chez le champignon de Paris, Agaricus bisporus.

Résumé

Le gène cox1 d’A. bisporus est connu comme étant le plus riche en introns de groupe I comportant des gènes d’endonucléase (homing endonuclease heg). Dans cet article nous avons étudié la variabilité génétique mitochondriale de dix souhes d’A. bisporus var. bisporus, une souches représentative de A. bisporus var. eurotetrasporus, et une souche d’Agaricus devoniensis qui est une espèce phylogénétiquement proche d’A. bisporus. Les introns de groupe I se sont révélés être la source principale de polymorphisme intraspécifique du gène cox. Les intron étudiés se divisent en deux groupe en fonction du gene heg qu’ils contiennent. Un groupe présente un heg conservant une fonctionnalité potentielle. L’autre groupe contient des séquences érodées de heg qui semblent évoluer vers leur élimination. Dans les deux types de séquences introniques nous avons noté des taux faibles de substitutions nucléotidiques. Cette tendance au faible taux de substitutions par rapport aux séquences nucléaires est partagée par tous les autres types de séquences mitochondriales, qu’elles soient introniques, géniques ou intergéniques. Ainsi l’évolution intraspecifique du génome mitochondrial d’A. bisporus se révèle être caractérisée par à la fois une mobilité importante des grands introns de groupe I et un faible taux de substitutions nucléotidiques. Cette conservation des  séquences mitochondriales comparée à leurs équivalents nucléaires n’est pas en lien avec leur fonctionnalité apparente et contredit ce qui est généralement admis sur l’évolution des séquences fongiques. Notre étude souligne l’utilité des séquences d’ADN mitochondrial pour progresser dans la connaissance de l’évolution intraspecifique.   

Jalalzadeh B, Carras Saré I, Férandon ., Callac P, Farsi M, Savoie J.M., Barroso G. (2015) The intraspecific variability of mitochondrial genes of Agaricus bisporus reveals an extensive group I Intron mobility combined with low nucleotide substitution rates. Current Genetics 61: 87-10.