Rattachée aux départements Santé des Plantes et Environnement (SPE) et Microbiologie de la Chaine Alimentaire (MICA) de INRAE, l’unité conduit ses recherches en partenariat avec d’autres équipes INRAE, des universités et des acteurs de la filière des céréales. Notre ambition est de contribuer à proposer des solutions pratiques pour diminuer le risque mycotoxique des céréales et ses conséquences sur la santé animale et humaine, et sur les pertes économiques pour les producteurs.

MycSA est au cœur du dispositif français de recherche et développement sur cette thématique. L’unité anime un réseau INRAE Fusatox qui cherche à prendre en compte toutes les composantes aboutissant à la présence dans l’alimentation humaine et animale de mycotoxines produites par les Fusarium. Elle assure aussi l’animation scientifique et participe activement au Réseau Mixte Technologique sur la Qualité Sanitaire des Productions Végétales de Grandes Cultures (RMT Quasaprov) et à partir de 2020 au RMT Al-Chimie sur les contaminations chimiques tout au long de la chaine alimentaire.  

Les recherches menées au sein de l’UR MycSA visent à atteindre une compréhension fine et exhaustive des évènements qui conduisent à la contamination des denrées végétales par des mycotoxines. Des développements fondamentaux sont associés à des études plus finalisées telles que la recherche de solutions préventives pour limiter le développement fongique et la production de mycotoxines ainsi que d’agents biologiques capables de dégrader ces toxines.

L’unité se positionne ainsi sur des fronts de science des domaines suivants :

-       l’analyse des réseaux métaboliques fongiques et leurs régulations ;

-       le décryptage du dialogue moléculaire hôte/pathogène ;

-       l’exploration des interactions biotiques et abiotiques au sein d’un pathobiome ;

-       l’étude de l’activité de biomolécules fongicides et/ou inhibitrices de la biosynthèse de toxines ;

-       l’analyse des voies de métabolisation fermentaire des mycotoxines ;

La voie d’entrée de nos travaux est le champignon mycotoxinogène et les paramètres principaux évalués en sortie sont la biosynthèse et l’accumulation de toxines. Les objets d’études privilégiés seront les espèces du genre Fusarium, et particulièrement les espèces productrices de mycotoxines de la famille des trichothécènes B (Fusarium graminearum essentiellement) et de mycotoxines dites émergentes (Fusarium avenaceum et Fusarium tricinctum). Une approche intégrée est mise en œuvre, autour de trois axes de recherche qui interagissent fortement entre eux

Axe 1 : La diversité des Fusarium spp conditionne leur potentiel toxinogène et l’accumulation de mycotoxines dans les grains.

Axe 2 : Les voies de biosynthèse des mycotoxines : détricoter les réseaux de régulation.

Axe 3 : L’environnement (bio-)chimique et microbien de Fusarium affecte l’accumulation de mycotoxines dans les grains.

Jusqu'à récemment, des chercheurs de MycSA s'intéressaient aux insectes des stocks de céréales d'une part et à la génétique et la biologie des champignons macroscopiques d'intérêt culinaire et médicinal d'autre part.