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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne - UMR 1287 EGVF

UMR 1287 - EGVF

Unité Mixte de Recherche (INRA, ENITAB, Université de Bordeaux)

Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne
I.S.V.V Bordeaux, 210 Chemin de Leysotte

33882 Villenave d’Ornon Cedex, France

GRAPEINSILICO

GRAPEINSILICO
Une plateforme de modélisation structure-fonction pour l’adaptation de la Vigne aux nouvelles contraintes

Financement: Plant2Pro
Partenariat: UMR LEPSE Montpellier
Période: Janvier 2021 - Juillet 2022
Responsable EGFV: Philippe VIVIN

Résumé: La viticulture, fleuron de l'économie nationale, doit innover pour s’adapter aux contraintes d’aujourd’hui et de demain, qu’elles soient de nature climatique, biotique ou socio-économique. Les modèles intégratifs structure-fonction sont des outils particulièrement pertinents pour soutenir ce besoin d’innovation, car ils permettent d’expliciter l’influence du génotype et des pratiques sur le phénotype (structure) et de les relier aux conséquences sur le rendement et sa qualité (fonction). Ils permettent donc de raisonner conjointement les cibles de sélection et les nouvelles pratiques pour adapter les vignobles à l’évolution des contraintes, aux innovations technologiques ou aux nouvelles attentes. La conception de tels outils passe par l’agrégation de modèles de recherche, focalisés sur différents aspects du fonctionnement ou du développement de la vigne. Ces modèles élémentaires sont nombreux pour répondre à des questions ciblées, mais ils ne rendent pas compte individuellement à l’ensemble des impacts possibles sur la plante et son environnement. L’objectif du projet GrapeInSilico est de créer un environnement de modélisation et de simulation modulaire, intégratif et de haute qualité logicielle permettant de rassembler et de mobiliser facilement ces acquis de la recherche. Il propose ainsi d’intégrer, sur une même plateforme informatique, différents modèles structure-fonction développés et publiés au sein de 3 entités Plant2Pro (LEPSE, EFGV et SAVE), de les enrichir de tutoriaux permettant de les utiliser seuls ou en association afin de faciliter, auprès des acteurs de la recherche et de nos partenaires privés, l’émergence de nouvelles applications. GrapeInSilico sera développé au sein la plateforme OpenAlea, reconnue internationalement et adoptée par une communauté large dans le domaine de la modélisation des plantes, afin de bénéficier de modules existants génériques (calculs biophysiques, dynamiques épidémiques,…) et de technologies d’intégration éprouvées. Les applications visées au terme du projet concernent la création variétale, l’assistance au phénotypage (en particulier sur les plates-formes de Plant2Pro) par inversion des modèles structure-fonction, l’optimisation des capteurs pour le suivi des plantes et, de manière plus finalisée, la création variétale et/ou l’aide à la conduite de la culture ou les innovations pour sa mécanisation.