Equipe Ecogere
Frédéric Revers
UMR 1202 BIOGECO
Biodiversité, Gènes & Communautés
Allée Geoffroy Saint-Hilaire
Bâtiment B2 - CS 50023
33615 Pessac Cedex
France
Tel : (+33)05 40 00 88 98
frederic.revers-at-inrae.fr
Formation
- Master 2 Recherche « Sciences de la Terre, Ecologie, Environnement », spécialité « Biodiversité et Ecosystèmes Terrestres », parcours « Fonctionnement des écosystèmes terrestres », 2015, Université de Bordeaux
- Habilitation à Diriger des Recherches, 2009, Université de Bordeaux
- Doctorat en Virologie Végétale, 1997, Université de Bordeaux
- DEA Biologie-Santé, 1992, Université de Bordeaux
- Elève de l’Ecole Normale Supérieure de Cachan (1988-1992). Agrégation de Biochimie-Génie biologique (1991)
J’ai été recruté à l’INRA comme chargé de recherche en 1997 dans l’équipe de Virologie Végétale (UMR 1332 BFP, Centre INRA de Bordeaux). Après plus de quinze ans dans cette thématique, j’ai pris la décision de réorienter mes recherches. Sensible aux enjeux liés à la biodiversité, pratiquant l'ornithologie depuis 25 ans et participant à plusieurs programmes de sciences participatives sur le suivi des oiseaux du MNHN (STOC-EPS, SHOC,...), j'ai souhaité poursuivre mes recherches en écologie en intégrant l'UMR BIOGECO en 2016 après avoir effectué un master d’écologie à l'Université de Bordeaux en 2015. Mes projets s’intéressent à mieux comprendre les relations entre la biodiversité (au travers d'approches multitaxons) et les facteurs environnementaux et anthropiques au sein de socio-écosystèmes variés tels que les milieux forestiers ou les paysages urbains. Un des objectifs principaux de ces projets est de produire des outils d'aide à la décision et à la gestion à destination des acteurs socio-économiques impliqués dans l'aménagement et la gestion des territoires. J'aborde ces projets dans un cadre interdisciplinaire en partenariat avec des équipes de recherche en sciences environnementales (climatologie, pédologie, télédétection, etc.) et des équipes en sciences humaines et sociales (sociologie, géographie, économie, urbanisme, architecture, paysagisme, etc.).
Thèmes et projets de recherche
* Depuis 2016
Ecologie des communautés : Etudes des relations entre facteurs environnementaux et biodiversité afin de produire des outils d'aide à la décision et à la gestion pour les politiques publiques en matière de conservation de la biodiversité au sein des socio-écosystèmes de Nouvelle-Aquitaine. Interactions de plus en plus fortes avec les sciences humaines et sociales et les parties prenantes de la société (gestionnaires, collectivités, associations, propriétaires, etc.)
Sites d’étude : Vallée du Ciron (affluent de la Garonne), Bordeaux Métropole, Campus universitaire de Bordeaux, PNR de la Région Nouvelle–Aquitaine, le cordon dunaire aquitain.
Partenariat scientifique: Institut des Mathématiques de Bordeaux, Unité ISPA (Physique de l'environnement, INRAE Bordeaux), Unité ETTIS (SHS, INRAE Bordeaux), Unité EABX (Ecologie aquatique, INRAE Bordeaux), UMR TETIS (Télédétection, INRAE Montpellier), ENSEGID, IGN, membre du Groupement de Recherche Pollinéco (pollinisation, réseaux d’interaction et fonctionnalité des écosystèmes), etc.
Partenariat non académique: ONF, le Syndicat Mixte d’Aménagement du Bassin Versant du Ciron, Observatoire de la Faune Sauvage de Nouvelle-Aquitaine (FAUNA, US Univ Bordeaux), Bordeaux Métropole, PNRs de Nouvelle-Aquitaine, Rectorat de Bordeaux, Maison pour la science, ...
--> Projets de recherche en écologie
- Projet Région Nouvelle-Aquitaine PollNA "Suivi des insectes pollinisateurs par les sciences participatives en Nouvelle-Aquitaine" (2023-2025)
- Projet ANR MaCCMic "Impact of forest Management and Climate Change on understory Microclimate" (2022-2026)
- Projet Life Wild bees "Wild bees in Regionals Naturals Parks of Nouvelle-Aquitaine, implementation on sectorial policies" (UE, 2021-2026)
- Projet SEEFOREST "Study of roles of socio-economic and ecological factors on forest socio-ecosystem functioning: example of the Ciron Valley" (Labex COTE, 2019-2021)
- Projet Frisbee "Apport de la fusion de données multisources lidar et optique pour une meilleure compréhension des relations entre structure forestière, biodiversité et microclimat" (CNES, 2019-2021)
- Projet région Nouvelle-Aquitaine CONFETTI « Caractérisation et suivi de l'écosystème forestier par télédétection multisources et multitemporelles » (2018-2021)
- Projets BiodiverCité#1 et #2 « Pour une approche multidisciplinaire de la préservation de la biodiversité en milieu urbain et périurbain à Bordeaux Métropole » (2017-2019; 2021-2026)
* 1997- 2014
Virologie végétale : Etude des déterminismes génétiques et moléculaires contrôlant les interactions Plante / Potyvirus
--> Projets de recherche en virologie végétale
- Projet ANR-Génoplante « ViroMouv » (projet ANR-08-GENM-016): Identification de facteurs de l’hôte impliqués dans le mouvement à longue distance des virus de plante (2009-2012, coordinateur).
- Projet INRA-SPE « Développement d’une approche de génétique d’association pour l’identification de loci impliqués dans les phénotypes de réponse aux Potyvirus chez Arabidopsis thaliana » financé par le département SPE (2010-2011).
- Projet INRA-SPE « Déterminants génétiques et moléculaires de l'interaction entre Potyvirus et Arabidopsis thaliana » financé par le département SPE (2005-2007).
- Projet de l’Action Structurante Tomate INRA « Modifications de la régulation du génome consécutives à l'infection par un Potyvirus : Etude comparative entre la tomate et Arabidopsis thaliana » (2003).
--> Responsabilités actuelles et passées
- Directeur d'unité adjoint de l'UMR BIOGECO depuis janvier 2023
- Responsable de l'équipe ECOGERE de janvier 2019 à décembre 2022
- Membre du groupe animation scientifique & technique de l'UMR BIOGECO de 2019 à 2022
- Membre du comité scientifique interdisciplinaire régional « GIEC Biodiversité » (ECOBIOSE) (2017-2019)
- Secrétaire Général de la Société Française de Phytopathologie de 2005 à 2010.
- Membre du comité d’organisation et du comité scientifique des 12ièmes (janvier 2009), 13ièmes (janvier 2011) et 14ièmes (janvier 2013) Rencontres de Virologie Végétale.
- Membre élu du Conseil Scientifique du Département « Santé des Plantes et Environnement » de l’INRA de 2006 à 2011.
- Membre de la CSS BIHASC de l’INRA de 2007 à 2010.
- Enseignement de 2003 à 2013 au niveau du Master Recherche 2ième année (Sciences de la vie, mention Biologie Santé, spécialité « Biologie et Biotechnologie des plantes », UE « Interactions Plantes-Pathogènes et Epidémiologie ») de l’Université Bordeaux.
- Enseignement depuis 2018 en L3 (TP de l'UE "Relevés et Inventaires des Organismes" sur les oiseaux) et Master 2 "Biodiversité et suivis environnementaux" (2h de cours sur les suivis des populations d'oiseaux) de l'Université de Bordeaux
Publications
Voir aussi mes profils Google Scholar et Researchgate
Acloque, A., Larrieu, L., Gouix, N., & Revers, F. (2023). Recording tree-related microhabitats to assess riparian forest contribution to biodiversity in landscapes dominated by conifer plantations. Biological Conservation, 286, 110261
Dayal, K. R., Durrieu, S., Lahssini, K., Monnet, J-M, Alleaume, S., Renaud, J.-P., Revers, F., (2022). An investigation into the effects of lidar scan angle on prediction of stand attributes in various forest environments. ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing, 193, 314-338.
Sahraoui Y., De Godoy Leski C., Benot M-L., Revers F., van Halder I., Salles D., Barneix M., Carassou L. (2021). Integrating ecological networks modelling in a participatory approach for assessing impacts of urban planning scenarios on landscape connectivity. Landscape and Urban Planning, 209, 104039. doi-org.docelec.u-bordeaux.fr/10.1016/j.landurbplan.2021.104039.
Dayal, K. R., Durrieu, S., Alleaume, S., Revers, F., Larmanou, E., Renaud, J. P., & Bouvier, M. (2020). Scan angle impact on lidar-derived metrics used in Aba models for prediction of forest stand characteristics: a grid based analysis. International Archives of the Photogrammetry, Remote Sensing and Spatial Information Sciences, 43, 975-982. https://dx.doi.org/10.5194/isprs-archives-XLIII-B3-2020-975-2020.
Rubio, B. , Cosson, P. , Caballero, M. , Revers, F. , Bergelson, J. , Roux, F. and Schurdi‐Levraud, V. (2019), Genome‐wide association study reveals new loci involved in Arabidopsis thaliana and Turnip mosaic virus (TuMV) interactions in the field. New Phytol. 221: 2026–2038.
Revers F., Benot M.L., Rosebery, D. & Alard D. (2018). La diversité de l’avifaune du cordon dunaire aquitain : quelles influences de l’environnement local et régional ? Faune-Aquitaine Publication, #0053-FA2018, http://www.fauneaquitaine.org
Sofer, L., Garcia Cabanillas, D., Gayral, M., Téplier, R., Pouzoulet, J., Ducousso, M., Dufin, L., Bréhélin, C., Ziegler-Graff, V., Véronique Brault, V., Revers, F. 2017. Identification of host factors potentially involved in the RTM-mediated resistance blocking potyvirus long distance movement. Archives of Virology, 162(7), 1855-1865.
Rodriguez-Medina,C., Boissinot, S., Chapuis, S., Gereige, D., Rastegar, M., Erdinger, M., Revers, F.; Ziegler-Graff, V., Brault, V. 2015. A protein kinase binds the C-terminal domain of the readthrough protein of Turnip yellows virus and regulates virus accumulation. Virology, 486, 44-53.
Cayla, T., Batailler, B., Le Hir, R., Revers, F., Anstead, J. A., Thompson, G. A., Grandjean, O., Dinant, S. 2015. Live imaging of companion cells and sieve elements in Arabidopsis leaves. Plos One, 10(2): e0118122. doi:10.1371/journal.pone.0118122.
Revers, F. and Garcia, J-A. 2015. Molecular biology of potyviruses. Advances in Virus Research 92, 101-199. (Highly cited paper)
Cosson, P., Decroocq, V., Revers, F. 2014. Development and characterization of 96 microsatellite markers suitable for QTL mapping and accession control in an Arabidopsis core collection. Plant Methods 10, 2.
Hipper, C., Brault, V., Ziegler-Graff, V., Revers, F. 2013. Viral and cellular factors involved in phloem transport of plant viruses. Frontiers in Plant Science 4:154.
Cosson, P., Schurdi-Levraud, V., Le Q.H., Sicard, O., Caballero, M., Roux, F., Le Gall, O., Candresse, T., Revers, F. 2012. The RTM Resistance to Potyviruses in Arabidopsis thaliana: Natural Variation of the RTM Genes and Evidence for the Implication of Additional Genes. PLoS ONE 7(6): e39169. doi:10.1371/journal.pone.0039169.
Cosson, P., Sofer, L., Le H., Leger, V., Schurdi-Levraud, V., Whitham, S.A., Yamamoto, M.L., Gopalan, S., Le Gall, O., Candresse, T., Carrington, J.C., Revers, F. 2010. RTM3 which controls long distance movement of potyviruses is a member of a new plant gene family encoding a meprin and TRAF homology (MATH) domain-containing protein. Plant Physiology, 154, 222-232.
Gallois, J-L., Charron, C., Sanchez, F., Pagny, G., Houvenaghel, M-C, Moretti, A., Ponz, F., Revers, F., Caranta, C. and German-Retana, S. 2010. Single amino acid changes in the Turnip mosaic virus viral genome-linked protein (VPg) confer virulence towards A. thaliana mutants knocked-out for eukaryotic initiation factors eIF(iso)4E and eIF(iso)4G. Journal of General Virology 91 (1), 288-293.
Decroocq, V., Salvador, B., Sicard, O., Glasa, M., Cosson, P., Svanella-Dumas, L., Revers, F., García, J. A., and Candresse, T. 2009. The Determinant of Potyvirus Ability to Overcome the RTM Resistance of Arabidopsis thaliana Maps to the N-Terminal Region of the Coat Protein. Molecular Plant-Microbe Interactions 22(10), 1302-1311.
Sicard, O., Loudet, O., Keurentjes, J.J.B , Candresse, T., Le Gall, O., Revers, F., Decroocq, V. 2008. Identification of QTLs controlling symptom development during viral infection in Arabidopsis thaliana. Molecular Plant-Microbe Interactions 21, 198-207.
Decroocq, V., Sicard, O., Alamillo, J-M., Lansac, M., Eyquard, J-P., García, J-A, Candresse, T., Le Gall, O., Revers, F. 2006. Multiple resistance traits control Plum pox virus infection in Arabidopsis thaliana. Molecular Plant-Microbe Interactions 19, 541-549.
Feng, D-X., Deslandes, L., Keller, H., Revers, F., Favery, B., Hirsch, J., Olivier, J. and Marco, Y. 2004. Isolation and characterization of a novel Arabidopsis thaliana mutant unable to develop wilt symptoms after inoculation with a virulent strain of the bacterial pathogen, Ralstonia solanacearum. Phytopathology 94, 289-295.
Dunoyer, P., Harrison, S., Revers, F., Thomas, C. and Maule, A. 2004. A cysteine-rich plant protein potentiates infection with Potyviruses through an interaction with the virus genome-linked protein, VPg. Journal of Virology 78, 2301-2309.
Revers, F., Guiraud, T., Houvenaghel, M.-C., Mauduit, T., Le Gall, O., Candresse, T. 2003. Multiple resistance phenotypes to Lettuce mosaic virus among Arabidopsis thaliana accessions. Molecular Plant-Microbe Interactions, 16, 608-616.
Duprat, A., Caranta, C., Revers, F., Menand, B., Browning, K., Robaglia, C. 2002. The Arabidopsis eucaryotic initiation factor (iso)4E is dispensable for plant growth but required for susceptibility to potyviruses . Plant Journal, 32, 927-934.
Revers, F., Le Gall, O., Candresse, T., Maule, A.J. 1999. New advances in understanding the molecular biology of plant/potyvirus interactions. Molecular Plant/Microbe Interactions, 12, 367-376.
Revers, F., van der Vlugt, R.A.A., Souche, S., Lanneau, M., Lot, H., Le Gall, O., Candresse, T., Dunez, J. 1999. Nucleotide sequence of the 3` terminal region of the genome of four lettuce mosaic virus isolates from Greece and Yemen. Archives of Virology, 144, 1619-1626.
Revers, F., Cao, T.L., Cario, M., Cazenave, C. 1999. Detection of proteins binding to short RNA.DNA hybrids or short antisense oligonucleotides in Xenopus laevis oocytes and human macrophage cell extracts by photoaffinity radiolabeling. Antisense and Nucleic Acid Drug Development, 9, 317-331 (Oligonucleotides depuis 2004).
Yang, S.J., Revers, F., Souche, S., Lot, H., Le Gall, O., Candresse, T., Dunez, J. 1998. Construction of full-length cDNA clones of lettuce mosaic virus (LMV) and the effects of intron-insertion on their viability in Escherichia coli and their infectivity to plants. Archives of Virology, 143, 2443-2451.
Candresse, T., Cambra, M., Dallot, S., Lanneau, M., Asensio, M., Gorris, M.T., Revers, F., Macquaire, G., Olmos, A., Boscia, D., Quiot, J.B., Dunez, J. 1998. Comparison of monoclonal antibodies and polymerase chain reaction assays for the typing of isolates belonging to the D and M serotypes of plum pox virus. Phytopathology, 88, 198-204.
Revers, F., Lot, H., Souche, S., Le Gall, O., Candresse, T., Dunez, J. 1997. Biological and molecular variability of lettuce mosaic virus isolates. Phytopathology, 87, 397-403.
Revers, F., Yang, S.J., Walter, J., Souche, S., Lot, H., Le Gall, O., Candresse, T., Dunez, J. 1997. Comparison of the complete nucleotide sequences of two isolates of lettuce mosaic virus differing in their biological properties. Virus Research, 47, 167-177.
Revers, F., Le Gall, O., Candresse, T., Le Romancer, M., Dunez, J. 1996. Frequent occurrence of recombinant potyvirus isolates. Journal of General Virology, 77, 1953-1965.
Cao, T.L., Revers, F., Cazenave, C. 1994. Production of double-stranded RNA during synthesis of bromouracil-substituted RNA by transcription with T7 RNA polymerase. FEBS Letters, 351, 253-256.
