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Technicienne de recherche en charge de l’étude du comportement de plantes face à l’infection virale (phénotypage et génotypage des interactions plantes-virus).

CV

• Diplômes :
  2002 - Baccalauréat Technologique Sciences et Recherches Laboratoires (Lycée Borde-Basse Castres)
  2004 - DUT Génie Biologique Option Agronomie (Paul Sabatier Toulouse)
• Parcours scientifique, expériences professionnelles :
  2004 - INRA UMR LSTM Montpellier (stagiaire -4mois-)
  2005 à 2007 - CIRAD-INRA UMR BGPI Montpellier (TRNO)
  2008 - INRA UMR GDPP Bordeaux (TRNO 8mois)
  2008 - INRA UMR BFP1332 Virologie Concours Externe TRNO

CONTACTS

E-Mail : melodie.caballero@inrae.fr
Tel. 05 57 12 23 91

Rattachement : UMR BFP 1332 Equipe Virologie

THEMES / MISSIONS DE RECHERCHE

Je travaille dans l’Unité Mixte de Recherche 1332 Biologie du Fruit et Pathologie dans l’équipe de Virologie Végétale au sein de la composante « génétique ». Les travaux de l’équipe de Virologie Végétale portent sur les virus phytopathogènes à ARN, plus précisément les potyvirus infectant les plantes. Les recherches de l’équipe sont structurées en plusieurs axes en interaction forte.

• Je travaille au sein de 2 axes de recherches qui sont :
  1/ Analyse de la réponse de la plante aux virus en conditions multi-stress : bases génétiques de la tolérance.
  2/ Génétique, génomique et recherche translationnelle chez les espèces fruitières à noyau : transformer les connaissances acquises sur les interactions plantes-virus en stratégies de résistance.
• Mes principales missions :
  1/ Mise en place et réalisation des expériences de phénotypage et de génotypage dans l’objectif d’étudier les interactions plantes-virus, pour un collectif de chercheurs.
  2/ Encadrement et suivi technique de stagiaires en formation (depuis Licence/BTS jusqu’au niveau Doctorant) et de contractuel niveau TR.
• Mes missions transverses :
  1/ Gestion d’un certain nombre de réactifs pour le collectif du laboratoire (stocks de tampons pour extraction de particules virales type « Bertheau » et de réactifs pour les tests sérologiques type ELISA).
  2/ Mise à jour de protocoles utilisés par le collectif.
  3/ Référente de la machine LightCycler® 480 (Q-PCR) et gestion du stock des réactifs/consommables.
  4/ Responsable de la pièce commune « Extraction » et de la pièce dite « Prunus ».
  5/ Référente « Sécurité Incendie » de l’équipe Virologie Végétale pour l’UMR 1332 BFP.
  6/Référente « Sauveteur Secouriste du Travail » de l’équipe de Virologie Végétale pour l’UMR 1332 BFP.

DOMAINES DE COMPETENCE / SPECIALITES SCIENTIFIQUES 

Responsable de la mise en place et de la gestion du déroulé/planning des expérimentations, principalement sur la plante modèle Arabidopsis thaliana

• Planification de la production de plantes nécessaire aux essais.
• Gestion d’un calendrier d’activités et d’un programme de tests de phénotypage.
• Préparation de produits de base (tampons, réactifs, solutions…).
• Tenue d’un cahier de laboratoire et compilations.
• Analyse et mise en forme des résultats.
• Présentation des résultats obtenus.

TECHNIQUES/SPECIALITES MAITRISEES

Expérimentations en serre et en laboratoire de biologie moléculaire et observations en microscopie à fluorescence

• Inoculation mécanique, biolistique et par Agrobacterium de plantes par différents virus (CMV, PPV, TuMV, TMV) en serres (niveau de confinement de type S2 ou S3) ou en chambre de culture.
• Suivi des plantes, observations et notations.
• Prélèvements de plantes pour réaliser des tests sérologiques ou moléculaires en laboratoire.
• Réalisation de tests sérologiques dits ELISA (détection spécifique de virus : PPV/CMV/TuMV/TMV ou avec des anticorps polyvalents : poly potyvirus).
• Extractions d’ADN et d’ARN, suivies de PCR ou RT-PCR.
• Synthèse d’ADN complémentaire à partir d’une matrice ARN (ADNc).
• Electrophorèse sur gel d’agarose ou sur séquenceur type LICOR.
• PCR quantitative ou en temps réel (LightCycler® 480).
• Observations en microscopie de virus taggués avec le gène codant pour la fluorescence verte (GFP) à l’AXIOZOOM.
• Analyses d’images avec le logiciel Image J.